Разработки СО РАН - каталог БД

На данной странице представлен каталог баз данных, включенных в Фонд алгоритмов и программ Сибирского отделения РАН. Полный каталог программ и БД, включенных в Фонд, а также любые выборки по научным центрам, объединенным ученым советам и др. вы можете найти на данной странице.

2021-10-22
Тесты по химии твёрдого тела

Назначение: обучение студентов по учебной дисциплине "Химия твёрдого тела".

Область применения: высшие учебные заведения.

Предполагается использование базы данных "Тесты по химии твёрдого тела" в составе соответствующего электронного учебного курса (базы данных) на платформе электронного обучения (e-learning) типа Moodle или других подобных программных продуктов. Элементы базы данных вносятся в соответствующие разделы интерактивных форм программных оболочек. Возможно самостоятельное формирование файла базы данных в различных форматах (например, программами Notepad или Excel) и написание программ обработки этого файла и пользовательских запросов на языках web-программирования (PHP и др.).

Полями базы данных являются:

1) Формулировка высказывания;

2) Правильные варианты высказывания;

3) Дистракторы (неправильные варианты);

4) Общее пояснение к ответу;

5) Пояснения к отдельным вариантам;

6) Тип задания (единственный или множественный выбор и др.);

7) Технические данные (количество вариантов, количество правильных вариантов).

Инструментальные средства создания - текстовый и графический редакторы.
2012-12-30
Web-ориентированная информационная система «Активная сейсмология с мощными вибрационными источниками»

Назначение – комплексная информационная поддержка научных исследований в области активной сейсмологии.

Область применения - исследование структуры земной коры верхней мантии.

Информационная система представляет собой web-ориентированную виртуальную рабочую среду, объединяющую следующие информационные ресурсы:

  • база экспериментальных данных, содержащая на сегодняшний день порядка 30000 сейсмотрасс, зарегистрированных в ходе экспериментов по вибросейсмическому просвечиванию Земли;
  • информационно-вычислительная система для анализа и визуализации данных в режиме on-line (зарегистрирована в Каталоге ФАП, номер DB10021);
  • база данных научных работ – электронная библиотека, содержащая тезисы и полные тексты статей, информацию об авторах и научных организациях;
  • библиографический каталог публикаций с возможностью поиска по авторам, названию, виду издания, году издания;
  • социальная сеть для создания рабочих групп, публикации статей пользователями, обсуждения размещенных на сайте материалов и т.д.

 Подробное описание системы можно посмотреть в публикациях:

[1] Григорюк А.П., Брагинская Л.П. Интернет-ресурс по вибросейсмическому мониторингу. Современное состояние и перспективы развития // Горный информационно-аналитический бюллетень. 2009. Т. 18. № 12. С. 200 – 204.

 [2] Григорюк А. П., Брагинская Л. П. Информационная система для комплексной поддержки научных исследований в области активной сейсмологии // Вестник Кемеровского государственного университета  № 4 (52) Т.2, 2012, С.43-48.

Функциональные возможности - каждая сейсмотрасса описывается 16 полями.
Инструментальные средства создания - web-сервер Apache, СУБД MySQL, интерпретатор PHP, С++ компилятор gcc, CMS Joomla.

Система доступна на сайте  http://opg.sscc.ru
2012-10-12
База данных событий широких атмосферных ливней

Назначение: хранение, обновление и предоставление данных по событиям широких атмосферных ливней (ШАЛ), вызываемых космическими лучами сверхвысоких энергий (КЛСВЭ), зарегистрированных Якутской комплексной установкой ШАЛ (ЯКУ ШАЛ).

Область применения: физика космических лучей, астрофизика, физика атомного ядра и элементарных частиц.

Функциональные возможности:

База Данных обеспечивает:

  • хранение и обновление данных по заряженной, мюонной и черенковской компонентам ШАЛ;
  • формирование выборки событий ШАЛ согласно желаемым критериям отбора для дальнейшего анализа;
  • многокомпонентный анализ характеристик ШАЛ;
  • анализ астрофизических параметров КЛСВЭ с энергиями выше 1018 эВ;
  • мониторинг качества работы детекторов установки в течение анализируемых периодов.

БД содержит события ШАЛ, начиная с 1995 г., в настоящий момент в ней 1511955 событий. БД содержит 10 таблиц. 

Подробное описание структуры БД - в приложенном файле.

Инструментальные средства создания - СУБД Postgresql-8.4.11
2011-11-29
Сайты связывания транскрипционных факторов (ТФСАЙТ)/ Transcription factor sites database (TFSITE)

База данных "Сайты связывания транскрипционных факторов (ТФСАЙТ)"  предназначена для накопления экспериментальных данных о сайтах связывания транскрипционных факторов в регуляторных районах генов эукариот.
В базу данных вносится следующая информация:
нуклеотидная последовательность сайта и его ближайшего окружения (20-40 н.п.),
позиции сайта относительно старта транскрипции,
область связывания с белком,
факторы, связывающиеся с этим сайтом,
влияние, которое оказывает связывание фактора на уровень транскрипции гена,
эксперименты, проведенные исследователями для доказательства связывания белка с последовательностью и функциональности сайта,
ссылки на базы данных и т.д.
Область применения - информационная биология, молекулярная генетика, медицина, фармакология.
2011-11-28
Регуляция транскрипции генов эндокринной системы (РТЭС); Endocrine System Transcription Regulatory Regions Database (ES-TRRD)

http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/papers/ignatieva/es-trrd/

База данных " Регуляция транскрипции генов эндокринной системы" содержит информацию:
i) о структурно-функциональной организации регуляторных районов, контролирующих транскрипцию генов эндокринной системы позвоночных (промоторах, энхансерах, сайленсерах, стартах транскрипции, сайтах связывания транскрипционных факторов);
ii) об особенностях экспрессии генов в зависимости от этапа индивидуального развития, типа клеток, влияния индукторов и т.д;
iii) о транскрипционных факторах, участвующих в регуляции.
Информация в базу данных РТЭС внесена на основе анализа научных публикаций, описывающих результаты экспериментальных исследований. Информация представлена в формате, позволяющем производить быстрый поиск и анализ данных.
База данных РТЭС является источником информации, на основе которой возможно построение моделей регуляторных районов генов, а также реконструкция генных сетей.
Назначение – исследование механизмов регуляции эндокринных функций позвоночных на уровне транскрипции.
Область применения - информационная биология, молекулярная генетика, физиология, медицина, фармакология.