ClustalW и ClustalX

ClustalW - Программа для множественного выравнивания последовательностей ДНК и белков.  Работает в два этапа. Первый - попарное выравнивание всех со всеми для оценки сходства. Второй этап - после построения филогенетического дерева выравнивание глобальное. Отличие программы ClustalW от ClustalX состоит в том, что в ClustalX используется графический интерфейс, в то время как ClustalW  работает через командную строку или он-лайн.