PROBCONS

Единственный алгоритм множественного выравнивания основанный на оценке вероятности эволюционного преобразования последовательностей на основе парной скрытой марковской модели. Используется алгоритмы итеративного улучшения выравнивания, прогрессивного выравнивание на основе дерева построенного по оценкам ожидаемой точности парных выравниваний последовательностей. Edgar RC. MUSCLE: a multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity. BMC Bioinformatics. 2004 5:113.