TREE-PUZZLE

Алгоритм, реализующий уникальный метод сборки филогенетического дерева с использованием информации о правдоподобии квартетов. TREE-PUZZLE также реализует методы тестирования филогении. Schmidt HA, Strimmer K, Vingron M, von Haeseler A. TREE-PUZZLE: maximum likelihood phylogenetic analysis using quartets and parallel computing. Bioinformatics. 2002 18:502-504. Strimmer K, von Haeseler A. Quartet puzzling: A quartet maximum likelihood method for reconstructing tree topologies. Mol Biol Evol. 1996 13: 964-969. Strimmer K, von Haeseler A. Likelihood-mapping: A simple method to visualize phylogenetic content of a sequence alignment. Proc Natl Acad Sci USA. 1997 94:6815-6819