BAUBLE

Тип разработки: 
Программа
Регистрационный номер в ФАП: 
PR10011
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-19
Тематическая направленность: 
молекулярная биология, химия
Разработчики программы (базы данных): 
Аннотация: 

Назначение - восстановление отсутствующих атомов в pdb файлах. Позволяет восстанавливать пропущенные атомы, не лежащие в основной белковой цепи, водороды. Возможно выполнение замен аминокислотных остатков.
Область применения - молекулярная биология, химия
Используемый алгоритм основывается на конформном преобразовании пространства для заданного в amino*.lib файлах образцов аминокислотных остатков к соответствующему аминокислотному остатку в белке. Позиции недостающих атомов восстанавливаются согласно преобразованному образцу.
Инструментальные средства создания - С++
Основывается на коде, опубликованном в "A library of software components for molecular modeling programs" авторов E.S. Fomin, N.A. Alemasov, A.S. Chirtsov and A.E. Fomin, Biophysics. 51, suppl. 1

Использованные при разработке материалы: 
нет
Регистрационный номер в Роспатенте: 
2008610261
Признак доступности программы (базы данных): 
доступ по запросу
Требования к аппаратным и программным средствам: 

LINUX, WINDOWS.

Контактная информация: 
fomin@bionet.nsc.ru