Программа автоматической генерации математических моделей генных сетей (МГСгенератор)

Тип разработки: 
Программа
Регистрационный номер в ФАП: 
PR10018
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-20
Тематическая направленность: 
Математическое моделирование, Молекулярная биология
Аннотация: 

Разработанная программа предназначена для автоматической реконструкции математической модели генной сети (ГС) на основе её структурно-функциональной организации. Программа позволяет: (1) для определённого набора структурных паттернов ГС генерировать математическую модель; (2) позволяет экспортировать полученную математическая модель в среды моделирования поддерживающие форматы «SiBML» и «SBML» и программный пакет «Mathematica», и (3) формировать базу математических моделей элементарных подсистем ГС.
Подробнее можно узнать в следуюших публикациях:
1) Ф.В. Казанцев, И.Р. Акбердин, К.Д. Безматерных, В.А. Лихошвай. Система автоматизированной генерации математических моделей генных сетей // информационный вестник ВОГиС, Т. 13. N. 1. 2009. С. 163-169
2) Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Гайнова И.А., Королев В.К., Медведев А.Е. (2009). Новые компьютерные технологии для построения, анализа и численного исследования математических моделей молекулярно-генетических систем. СибЭМЖ, Том VI, стр. 440-456.

Использованные при разработке материалы: 
Разрабатывалась как RCP приложение в среде программирования ECLIPSE на языке JAVA
Регистрационный номер в Роспатенте: 
СВИДЕТЕЛЬСТВО №2008611941, 18 апреля 2008
Признак доступности программы (базы данных): 
доступ по запросу
Требования к аппаратным и программным средствам: 

ОС: Windows XP+ / Linux

Контактная информация: 
kazfdr@bionet.nsc.ru