Разработки СО РАН - каталог БД

На данной странице представлен каталог баз данных, включенных в Фонд алгоритмов и программ Сибирского отделения РАН. Полный каталог программ и БД, включенных в Фонд, а также любые выборки по научным центрам, объединенным ученым советам и др. вы можете найти на данной странице.

2010-04-19
Гены-сенсоры (GenSensor)

База данных GenSensor предназначена для накопления информации, необходимой для создания геносенсорных конструкций на основе бактериальных генов и содержит данные о структуре бактериальных промоторов, экспрессия которых активируется в ответ на определенное внешнее воздействие, механизмах индукции, а также условий, при которых наблюдается максимальный ответ на данный тип воздействия.
База может быть использована для поиска генов, чувствующих присутствие в среде различных токсических для клетки веществ, и представляет интерес для исследователей, занимающихся разработкой и созданием новых, высокоэффективных и чувствительных методов, которые бы в отсутствие знаний о природе токсического для клетки вещества, выявляли его присутствие в биологических средах.
Источником информации для базы является аннотация научных статей, опубликованных в открытой печати.
Язык программирования: Icarus,
СУБД: Sequence Retrieval System (SRS),
Операционная система: UNIX, Linux.
Структура и формат базы описаны в: Khlebodarova T.M., Tikunova N.V., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A. Application of bioinformatics resources for genosensor design. // J. Bioinform. Comput. Biol. 2007. V. 5. P. 507-520.
2010-04-16
Генные сети Арабидопсиса (ГСА) / Arabidopsis GeneNet Supplementary (AGNS)

Функциональные возможности базы данных:  База данных “Генные сети Арабидопсиса (ГСА)” содержит информацию о генах, регулирующих морфогенез, их экспрессии, влиянии мутаций на молекулярный и морфологический фенотип растений. На основе наиболее изученного с генетической точки растения и наиболее секвенированного и аннотированного к настоящему времени генома эукариот, AGNS обеспечивает представление данных по морфогенезу растений в формате, детально описывающем морфогенез от нуклеотидной последовательности до фенотипа, и, в тоже время, позволяющем производить компьютерный логический анализ этих данных.
Назначение - Ресурс по экспериментальным данным о паттернах экспрессии и фенотипическим аномалиям развития арабидопсиса.
Область применения - Генетика развития растения.
Инструментальные средства создания - Java, Berkeley DB XML.
2010-02-15
Электронный архив академика А.П. Ершова

Информационная система, содержащая более 40 тысяч документов (более 150 тысяч страниц) архива А.П. Ершова, каталогизированных по темам и физическим папкам.
2010-02-15
Каталог математических Интернет-ресурсов MathTree

Разработан древовидный каталог математических ресурсов, в котором все разделы математики разбиты на 7 больших ветвей. Каждая из ветвей разделяется на несколько менее широких ветвей и так далее. На разных уровнях каталога хранятся данные, связанные с конкретным разделом математики. За основу систематизации математических ресурсов взята международная классификация разделов математики MSC 2000, принятая в реферативных журналах Mathematical Reviews и Zentralblatt. В настоящее время в каталоге находится: ресурсов - 5066, разделов - 308. В классификаторе MSC2000 содержится 5490 разделов (из них переведено на русский язык 4883 раздела). Классификатор ГРНТИ содержит 146 математических разделов.