Разработки СО РАН - каталог БД
На данной странице представлен каталог баз данных, включенных в Фонд алгоритмов и программ Сибирского отделения РАН. Полный каталог программ и БД, включенных в Фонд, а также любые выборки по научным центрам, объединенным ученым советам и др. вы можете найти на данной странице.
|
2010-04-19
База данных Пространственные структуры функциональных сайтов белков (ПДБСАЙТ)/Spatial structure of protein functional sites (PDBSite) предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконструкции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем. База данных содержит информацию о пространственной структуре функциональных сайтов белков, включая: сайты каталитических центров ферментов, сайты пострансляционных модификаций белков, сайты связывания ионов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания ДНК и РНК. База данных обеспечивает пользователя информацией о функционально важных свойствах структуры белков, необходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска мишеней для лекарственных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшенными медико-биологическими свойствами. |
|
2010-04-19
База данных RealSite предназначена для накопления информации по структуре функциональных сайтов связывания транскрипционных факторов (ССТФ) у про- и эукариот. База основана на описании структуры ССТФ с помощью частотных матриц, которые построены в результате выравнивания представительных выборок нуклеотидных последовательностей ССТФ. В базе данных RealSite выборки ССТФ созданы на основе только тех последовательностей ДНК, функциональность которых в структуре промотора подтверждена экспериментально. База RealSite служит основой для решения ряда актуальных задач биоинформатики и представляет интерес для исследователей, занимающихся распознаванием сайтов связывания ТФ, изучением механизмов транскрипции и реконструкцией генных сетей. |
|
2010-04-19
База данных ArtSite предназначена для аннотации экспериментальной информации по структуре сайтов связывания транскрипционных факторов (ТФ) у про- и эукариот. База основана на описании структуры сайтов связывания ТФ с помощью частотных матриц, которые построены в результате выравнивания представительных выборок нуклеотидных последовательностей сайтов связывания ТФ. Выборки сайтов созданы на основе in vitro синтезированных последовательностей, выявленных с помощью различных методов селекции, и описанных в научных статьях, опубликованных в открытой печати. База представляет интерес для всех исследователей, занимающихся изучением механизмов регуляции экспрессии генов как у про-, так и у эукариот и может быть использована для распознавания сайтов связывания ТФ при исследовании геномов различных видов организмов. |
|
2010-04-19
База данных ConSensor предназначена для накопления информации о существующих в научной литературе геносенсорных разработках и содержит данные о структуре и эффективности этих конструкций. |
|
2010-04-19
База данных ассоциативных сетей (ЭНДЦелл)/Associative network database (ANDCell) предназначена для реконструкции ассоциативных сетей, описывающих молекулярно-генетические взаимодействия в клетке, а также ассоциативные связи генов с заболеваниями. База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением молекулярно-генетических систем. |