Растения, Паттерны, Фенотипы (3П-ДБ) / Plants, Patterns, Phenotypes (3P-DB)

Тип разработки: 
База данных
Регистрационный номер в ФАП: 
DB10014
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-20
Тематическая направленность: 
Генетика развития растения
Аннотация: 

Назначение - Ресурс по экспериментальным данным о паттернах экспрессии и фенотипическим аномалиям развития корней растений.
Область применения - Генетика развития растения.
Используемый алгоритм - Систематизация данных, основанная на биологических онтологиях.
Функциональные возможности - База данных «3P-DB» предназначена для интеграции данных об экспрессии генов растений разных видов в развитии на молекулярном, тканевом и фенотипическом уровнях. Информационная часть базы данных (БД) «3P-DB» состоит из следующих разделов: БД генов, мутантов и трансгенных конструкций растений разных видов; БД по экспрессии генов растений в норме, при мутациях, в трансгенах и при обработке активными веществами и факторами; БД фенотипических аномалий развития корневых систем; терминологические системы. К терминологическим системам в первую очередь относится онтология развития корневых систем растений, которая состоит из двух контролируемых словарей по: (1) стадиям развития корневой системы и (2) анатомии и морфологии корневой системы. К программным компонентам БД «3P-DB» относятся: система ввода и редактирования, интернет-сайт с системой запросов, веб-интерфейс онтологии развития корневых систем растений.
Инструментальные средства создания - Java, Berkeley DB XML.

Использованные при разработке материалы: 
Опубликованные статьи
Признак доступности программы (базы данных): 
полностью свободный доступ
Требования к аппаратным и программным средствам: 

Процессор 1,8-2,0 ГГц, Оперативная память 512 Мбайт, Браузер Mozilla Firefox version 3.0 or higher, Java Virtual Machine 1.5 or higher.

Контактная информация: 
kviki@bionet.nsc.ru

Залевский Евгений Михайлович

Телефон: 
(383)363-49-22
E-mail: 
zalevskyatbionet [dot] nsc [dot] ru

Институт автоматики и процессов управления ДВО РАН

Сокращенное название: 
ИАПУ ДВО РАН
Почтовый индекс: 
690041
Почтовый адрес: 
г. Владивосток, улица Радио, дом 5
Телефон: 
(4232)310439

Институт вычислительных технологий СО РАН

Сокращенное название: 
ИВТ СО РАН
Почтовый индекс: 
630090
Почтовый адрес: 
Новосибирск, пр. Ак. Лаврентьева, 6
Телефон: 
+7(383) 330-61-50
Факс: 
+7(383) 330-63-42
E-mail: 

Ратушный Александр Владимирович

E-mail: 
aratushnyatsystemsbiology [dot] org

Подколодная Наталья Николаевна

E-mail: 
nataatbionet [dot] nsc [dot] ru

Лашин Сергей Александрович

E-mail: 
lashinatbionet [dot] nsc [dot] ru

Безматерных Кирилл Дмитриевич

E-mail: 
bezmateatbionet [dot] nsc [dot] ru

Акбердин Илья Ринатович

E-mail: 
akberdinatbionet [dot] nsc [dot] ru

Казанцев Федор Владимирович

E-mail: 
kazfdratbionet [dot] nsc [dot] ru
Ленты новостей