База данных ProkaTEX предназначена для накопления экспериментальных данных по структуре регуляторных районов генов у различных видов бактерий, а также данных по экспрессии генов в зависимости от стадии роста бактериальной культуры, источников питания и дыхания, различных внешних воздействий и т.д.
Комплексное описание регуляции транскрипции генов прокариот, представленное в базе ProkaTEX, является основой для решения большого числа актуальных задач биоинформатики и представляет интерес для исследователей, занимающихся анализом закономерностей структурно-функциональной организации районов регуляции транскрипции генов прокариот; распознаванием сайтов связывания транскрипционных факторов; изучением механизмов транскрипции; реконструкцией генных сетей; моделированием молекулярно-генетических процессов в бактериальной клетке; интерпретацией данных microarray и т.д.
Источником информации для базы является аннотация научных статей, опубликованных в открытой печати.
Язык программирования: Icarus
СУБД: Sequence Retrieval System (SRS)

База данных нанобиотехнологий (НАНОБИОТЕХБАЗЕ) предназначена для хранения и поиска информации о нанобиотехнологиях. База данных может быть использована в области нанобиотехнологии, биотехнологии, молекулярной биологии, медицины, а также других областях, в которых используются нанотехнологии. База данных содержит информацию о названиях, описаниях и областях применения нанобиотехнологий, автоматически извлеченную из текстов рефератов базы данных Pubmed методами Text-Mining.

База данных нанобиоматериалов (НАНОБИОБАЗА) предназначена для хранения и поиска информации о названиях и свойствах нанобиоматериалов. База данных может быть использована в области нанобиотехнологии, биотехнологии, молекулярной биологии, медицины, а также других областях, в которых используются наноматериалы. База данных содержит информацию, автоматически извлеченную из текстов рефератов базы данных Pubmed методами Text-Mining.

База данных Пространственные структуры функциональных сайтов белков (ПДБСАЙТ)/Spatial structure of protein functional sites (PDBSite) предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконструкции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем. База данных содержит информацию о пространственной структуре функциональных сайтов белков, включая: сайты каталитических центров ферментов, сайты пострансляционных модификаций белков, сайты связывания ионов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания ДНК и РНК. База данных обеспечивает пользователя информацией о функционально важных свойствах структуры белков, необходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска мишеней для лекарственных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшенными медико-биологическими свойствами.